约翰汉蒙为了繁衍绝种的 恐龙 ，在一座小岛使用化石残留的遗传基因，成功繁殖出各种恐龙，并在岛上兴建一座主题乐园侏罗纪公园，但是他原先的美意却严重失控，霸王龙和迅猛龙群起攻击岛上的人类，并造成多人惨死，八年后，波多黎各政府设法将岛上的恐龙全数消灭，并将这座世界仅有的恐龙栖息地全面封锁，不准任何人踏上小岛一步。

但是四年后，现在以大自然保护者自居的汉蒙却透露，另外有一座小岛被做为培育古代 恐龙 的第二实验地点，虽然当地的情况一度被控制住，但是在一次大风暴侵袭实验室之后，这些凶猛的史前掠食动物逃到野外，而令人意外的是，这些恐龙找到生存的方法，并在这个完美的生态环境里持续繁衍。

如今又过了四年，第一位造访侏罗纪公园的古生物学家艾伦葛兰发现，在这第二座小岛，被称为失落的世界的索纳岛上，隐藏着更大的凶险......